聖克拉拉大學共有6個學院，包括了藝術與科學學院、教育與心理諮商學院、商學院、工程學院、神學院、及法學院。各個學院都提供了各種不同等級的高等教育學位，並且廣泛地被美國認可為第一級大學研究機構學位。藝術與科學學院提供廣泛的人文、藝術、物理和社會科學相關課程，如人類學、生物化學、計算機科學、民族研究以及社會學等。工程學院的設立宗旨在於滿足矽谷對專業工程師不斷增長的需求，學院提供了很多與高科技公司和政府機構密切合作的機會。