身為一所優質的綜合研究型大學，佩珀代因雖然只開設了5個院所，分別是文理學院、商業與管理學院、教育與心理研究院、法學院和公共政策學院，設有大學生課程、碩士和博士課程，提供學生優良的教育品質以及教育資源，但也為學生提供了豐富的課程選擇。學院的特色基督教教育理念，為學生提供了創新性教育。佩珀代因大學在US News上最有價值綜合大學排行是第29名、商學院第65名、公共政策學院第68名、法學院第72名。佩珀代因大學本身雖是偏保守的基督教學校，但對於學生的信仰保持開放態度，並無特別限制學生的信仰喜好，只為了追求更優秀的人才培育機會。